Revealing textual polarity patterns with a browser extension

We describe a new method to combine sentiment analysis and web augmentation into a browser-based platform enabling visualization of a web document's opinionated expressions and patterns of polarity. The Augmentator extension assists the reader recognizing keywords and paragraphs of polarity sentiment with the idea that by moving a part of the problem of text analysis from statistics and data mining into the realm of human vision and recognition, non-professionals can hopefully benefit more easily from powerful analysis and visualization tools.ye

Introducing the Author-ity Exporter, and a case study of geo-temporal movement of authors

We introduce a web service, Author-ity Exporter, that permits searching and exporting data from Author-ity -- a database that has PubMed author names disambiguated with a high degree of accuracy [1]. Each author is represented by a cluster of papers annotated by publication count, time-span, affiliations, topics, journals, co-authors, citations as well as imputed data from MapAffil [2], Genni [3], and Ethnea [4] and links to their NIH/NSF grants and USPTO patents; and we have plans for more. This service should enable and simplify new types of author-centered bibliometric analyses with a unique strength in funding, geography, and diversity (gender, ethnicity, and professional age). We also present an illustrative case study of modeling of authors’ career movements to and from a specific city based on data retrieved from Author-ity Exporter. The service (and the R code used in the case study) are available at http://abel.ischool.illinois.edu/cgi-bin/exporter/search.pl.NIH P01AG039347Ope

How does it really feel to act together? : Shared emotions and the phenomenology of we-agency

Research on the phenomenology of agency for joint action has so far focused on the sense of agency and control in joint action, leaving aside questions on how it feels to act together. This paper tries to fill this gap in a way consistent with the existing theories of joint action and shared emotion. We first reconstruct Pacherie’s (Phenomenology and the Cognitive Sciences, 13, 25–46, 2014) account on the phenomenology of agency for joint action, pointing out its two problems, namely (1) the necessary trade-off between the sense of self- and we-agency; and (2) the lack of affective phenomenology of joint action in general. After elaborating on these criticisms based on our theory of shared emotion, we substantiate the second criticism by discussing different mechanisms of shared affect—feelings and emotions—that are present in typical joint actions. We show that our account improves on Pacherie’s, first by introducing our agentive model of we-agency to overcome her unnecessary dichotomy between a sense of self- and we-agency, and then by suggesting that the mechanisms of shared affect enhance not only the predictability of other agents’ actions as Pacherie highlights, but also an agentive sense of we-agency that emerges from shared emotions experienced in the course and consequence of joint action.Peer reviewe

Verkkolehden julkaisujärjestelmän kehittäminen

Tämän insinöörityön puitteissa suunniteltiin ja toteutettiin yleistajuiselle sosiologian alan verkkolehdelle julkaisujärjestelmä. Tavoitteena oli löytää parhaat toimintatavat Catalystsovelluskehyksen käytössä sekä tutkia sitä miten toteutetaan kevyt ja selkeä web-käyttöliittymä. Työn alkuosassa käytiin läpi dynaamisen webin toteutustekniikoita ja erilaisia MVC-arkkitehtuurimallia (malli-näkymä-ohjain) toteuttavia web-sovelluskehyksiä. Näihin kuuluvat työssä käytetyn Catalystin lisäksi muun muassa Django ja Ruby on Rails. Todettiin, että verkkosovellusten suunnittelussa ja toteutuksessa web-sovelluskehys on hyödyllinen sen hoitaessa useat sovelluksen rutiininomaiset tehtävät ja se eriyttää sovelluksen eri komponentit loogisella tavalla. Verkkolehden julkaisujärjestelmälle asetettuja tavoitteita olivat muun muassa käyttämisen helppous ja käyttöliittymän ulkoasun keveys ja selkeys. Työssä käytiin läpi näihin liittyviä käsitteitä ja suosituksia ja analysoitiin soveltuvia toteutustapoja. Järjestelmän MVC-mallin mukaisten komponenttien toiminta käytiin läpi ohjelmakoodiesimerkkejä apuna käyttäen. Huomattiin, että verkkosovelluksen käytännön toiminnasta johtuen puhtaan MVC-järjestelmän toteutus on haastavaa, sillä selainkäyttöliittymässä näytettyä sisältöä joudutaan jonkin verran käsittelemään ja räätälöimään ohjainkomponentissa. Tällöin ohjain- ja näkymäkomponentit eivät ole vapaasti vaihdettavia. Catalystin kaltainen MVC-mallia toteuttava web-sovelluskehys on käytännöllinen ja tehokas verkkosovelluksen toteutuksessa. Erityisen tärkeä etu tällaisen sovelluskehyksen käytössä on se, että tällöin ohjelmointiprosessin painopiste siirtyy aikaisempaa enemmän järjestelmäsuunnittelun suuntaan, jolloin tietoturva-asioihin ja järjestelmän toiminnan sekä tietokannan suunniteluun voidaan keskittyä paremmin.Within this thesis project a managing system was developed for a web magazine of the sociology field. The aim was to find the best practices in the use of the Catalyst web framework and to research the implementation of a light-weight and clear web user interface. In the first part of the work some technologies of dynamic web and different web frameworks implementing the model-view-controller architecture model were described. Among these are, in addition to Catalyst which was used in this project, Django and Ruby on Rails. It was concluded that in the design and development of web applications a web framework is useful as it takes care of most of the everyday routines of the application and it separates the application's different components in a logical way. Some aims laid down for the system were, among others, the ease of use and lightweightness and clearness of the user interface. Related terms and recommendations were discussed and applicable implementation methods were analysed. The functionality of the system's MVC components was described with the aid of code samples. It was observed that due to the reasons of practical functionality developing a pure MVC system is challenging because in a browser user interface the presented content has to be somewhat processed and tailored in the controller component. Thus the controller and view components are not freely interchangeable. A web framework implementing the MVC model, such as Catalyst, is both convenient and efficient in the development of a web application. An especially important advantage in the use of a framework like this is that the focus of the software development process shifts to the direction of system design, enabling the developers to concentrate more on issues related to security, system functionality and the design of the database

Sateenkaariperhe varhaiskasvatuksessa : Päivähoidon työntekijöiden kokemukset, odotukset ja tietoisuus

Opinnäytetyömme tarkoituksena oli selvittää, millaisia kokemuksia, mahdollisia oletuksia sekä ajatuksia päivähoidon henkilökunnalla oli yhteistyöstä sateenkaariperheiden kanssa sekä millä tasolla tietoisuus sateenkaariperheisiin liittyen on. Tutkimus toteutettiin haastatellen Tampereen päivähoidon työntekijöitä, käyttäen teemahaastattelua. Haastattelimme sekä työntekijöitä, joilla oli kokemusta yhteistyöstä sateenkaariperheiden kanssa, että työntekijöitä, joilla ei ollut kokemusta, tavoitellen vertailevaa tulosta vastaajien välille. Perhemuotona sateenkaariperhe yleistyy sekä näiden perheiden lukumäärä kasvaa vuosi vuodelta, jonka seurauksena perheiden lapsia on myös enemmän päivähoitojärjestelmän piirissä. Päivähoidon henkilökunnan onkin tärkeää tunnistaa nämä perheet, jotta heidät voidaan ottaa huomioon mahdollisine erityistarpeineen, lapsen kasvatuksessa korostaen lähtökohtien huomioon ottamista. Sateenkaariperheen kanssa työskentely ei niinkään vaadi erityistaitoja, vaan pikemminkin moninaisuuden sekä erilaisuuden huomioimista ja arvostamista. Perheen vanhempien kanssa tehtävä yhteistyö avoimen keskustelun sekä kasvatuskumppanuuden merkityksen muistamisen muodossa ovat avainasemassa. Tutkimuksemme tuloksista käy ilmi, ettei yhteistyön tunnettu poikkeavan verrattaessa muiden perheiden kanssa tehtävään yhteistyöhön, eivätkä myöskään oletukset mahdollisesta yhteistyöstä aiheuta tarvetta opetella erityistaitoja. Työntekijät, joilla oli aiempaa kokemusta yhteistyöstä, näkivät yhteistyön hyväksi, arvottaen avoimen keskustelun ja kysymisen rohkeuden taitoja. Työntekijät, joilla ei ollut kokemusta, suhtautuivat tulevaisuuden mahdolliseen yhteistyöhön avoimin mielin. Tietoisuus sateenkaariperheisiin oli hyvin yleisellä tasolla, johon kuitenkin nähtiin voivan vaikuttavan omalla aktiivisuudella, mikäli tietoa tarvitsisi lisää. Kaikkien haastateltavien kesken omat tiedot sekä yhteistyöhön liittyvät taidot koettiin riittäviksi sateenkaariperheiden kanssa tehtävän yhteistyön tueksi. Sateenkaariperheet koettiin kuitenkin aiheeksi, joka olisi hyvä lisätä alan koulutusohjelmiin, jolloin tietoja sekä taitoja yhteistyön tueksi saataisiin jo opiskeluvaiheessa. Tämän avulla sateenkaariperhe perhemuotona nousisi yleisemmäksi asiaksi, korvaten tämänhetkisen tilanteen, jossa kyseinen perhemuoto jää vaille käsittelyä. Opinnäytetyöstämme on hyötyä varhaiskasvatuksen kentällä työskenteleville, jotka haluavat lisätä tietoaan moninaisuudesta perheiden parissa, sekä seksuaalivähemmistöjen kanssa tehtävästä yhteistyöstä kiinnostuneille

Quantitative Proteomics Reveals GIMAP Family Proteins 1 and 4 to Be Differentially Regulated during Human T Helper Cell Differentiation *S⃞

T helper (Th) cells differentiate into functionally distinct effector cell subsets of which Th1 and Th2 cells are best characterized. Besides T cell receptor signaling, IL-12-induced STAT4 and T-bet- and IL-4-induced STAT6 and GATA3 signaling pathways are the major players regulating the Th1 and Th2 differentiation process, respectively. However, there are likely to be other yet unknown factors or pathways involved. In this study we used quantitative proteomics exploiting cleavable ICAT labeling and LC-MS/MS to identify IL-4-regulated proteins from the microsomal fractions of CD4+ cells extracted from umbilical cord blood. We were able to identify 557 proteins of which 304 were also quantified. This study resulted in the identification of the down-regulation of small GTPases GIMAP1 and GIMAP4 by IL-4 during Th2 differentiation. We also showed that both GIMAP1 and GIMAP4 genes are up-regulated by IL-12 and other Th1 differentiation-inducing cytokines in cells induced to differentiate toward Th1 lineage and down-regulated by IL-4 in cells induced to Th2. Our results indicate that the GIMAP (GTPase of the immunity-associated protein) family of proteins is differentially regulated during Th cell differentiation